Z výše uvedených čtyř podmínek pro zakládání veřejné podpory jsou v případě podpory z ROP JV první tři podmínky naplněny vždy a prakticky se zkoumá podmínka čtvrtá.
Každý žadatel si musí položit základní otázku, pro jaké cílové skupiny je jeho projekt vytvořen a zda existuje v oblasti, ve které projekt působí, ekonomická konkurence. Jde tedy o tzv. analýzu relevantního trhu. Zda je realizátorem projektu podnikatel, není pro stanovení veřejné podpory určující. Důležitá je jeho činnost. Pokud tato činnost zasahuje do činnosti jiných podnikatelů, jedná se o veřejnou podporu. Výjimkou je pouze případ služeb obecného (veřejného) zájmu.
Například:
- V případě, že projekt je zaměřen na výstavbu cyklostezky sloužící všem osobám bez rozdílu, její užití nebude zpoplatněno a jejím vybudováním nebude ohrožen ve své činnosti jiný ekonomický subjekt, nejedná se o veřejnou podporu a žadateli lze poskytnout dotaci až do max. výše 85 % z prostředků SF.
V případě, že projekt svým zaměřením ohrožuje jiné ekonomické subjekty tím, že zasahuje do trhu, může reálně „přetáhnout“ zákazníky, jedná se o veřejnou podporu a projektu je možno poskytnout podporu pouze za určitých podmínek, obvykle v režimu nařízení nebo na základě notifikované podpory podle čl. 108 Smlouvy o fungování EU, odsouhlasené EK. Na žadateli je právní odpovědnost za přijetí zakázané veřejné podpory, neboť on bude případně sankcionován tím, že ji bude muset později poskytovateli vrátit.
- Obec provozuje hostinec
České právo umožňuje obcím podnikat a umožňuje jim i např. provozovat hostinec. Takovou činností obec zasahuje do relevantního trhu. Existují i další podnikatelé provozující danou ekonomickou činnost. Na obec je třeba v případě tohoto projektu hledět jako na podnikatele a jedná se o veřejnou podporu. V tomto případě se uplatní výjimka dle nařízení 1628/2006. Vzhledem k tomu, že obec nespadá pod definici malého a středního podnikatele, má možnost získat na projekt dotaci ve výši max. 40 %.
V době před registrací projektu nesmí být zahájeny práce na projektu zakládajícím veřejnou podporu (tzn., nesmí být zahájeny zejména stavební práce na projektu, nebo nesmí být učiněna závazná objednávka služeb související s realizací projektu).
V některých případech je však možné již předložený (zaregistrovaný) projekt k hodnocení, vyřazený na základě nesplnění formálních náležitostí, kritérií přijatelnosti nebo projekt nedoporučený k financování (tzn. situaci, kdy projekt nedosáhl potřebného množství bodů při bodovém hodnocení), opětovně předložit k hodnocení, přičemž realizace projektu nemusí být do další registrace přerušena (stavební a jiné práce mohou pokračovat, závazná objednávka služeb může být učiněna). Mohou vznikat způsobilé výdaje. Týká se pouze projektů, které v souladu s harmonogramem uvedeným v projektové žádosti prvotně registrovaného projektu, již zahájili realizaci.
Podmínky opětovné registrace projektu jsou řešeny v Metodickém pokynu Úřadu Regionální rady regionu soudržnosti Jihovýchod č. 3/2008 EX, který je k dispozici na http://www.jihovychod.cz/ v záložce „Metodické pokyny".Tento metodický pokyn se týká i projektů, které nezakládají veřejnou podporu.
