Z výše uvedených čtyř podmínek pro zakládání veřejné podpory jsou v případě podpory z ROP JV první tři podmínky naplněny vždy a prakticky se zkoumá podmínka čtvrtá.

Každý žadatel si musí položit základní otázku, pro jaké cílové skupiny je jeho projekt vytvořen a zda existuje v oblasti, ve které projekt působí, ekonomická konkurence. Jde tedy o tzv. analýzu relevantního trhu. Zda je realizátorem projektu podnikatel, není pro stanovení veřejné podpory určující. Důležitá je jeho činnost. Pokud tato činnost zasahuje do činnosti jiných podnikatelů, jedná se o veřejnou podporu. Výjimkou je pouze případ služeb obecného (veřejného) zájmu.

Například:

1. V případě, že projekt je zaměřen na výstavbu cyklostezky sloužící všem osobám bez rozdílu, její užití nebude zpoplatněno a jejím vybudováním nebude ohrožen ve své činnosti jiný ekonomický subjekt, nejedná se o veřejnou podporu a žadateli lze poskytnout dotaci až do max. výše 85 % z prostředků SF.
   
   V případě, že projekt svým zaměřením ohrožuje jiné ekonomické subjekty tím, že zasahuje do trhu, může reálně „přetáhnout“ zákazníky, jedná se o veřejnou podporu a projektu je možno poskytnout podporu pouze za určitých podmínek, obvykle v režimu nařízení nebo na základě notifikované podpory podle čl. 88/3 Smlouvy o založení ES, odsouhlasené EK. Na žadateli je právní odpovědnost za přijetí zakázané veřejné podpory, neboť on bude případně sankcionován tím, že ji bude muset později poskytovateli vrátit.
   
   
2. Obec provozuje hostinec
   
   České právo umožňuje obcím podnikat a umožňuje jim i např. provozovat hostinec. Takovou činností obec zasahuje do relevantního trhu. Existují i další podnikatelé provozující danou ekonomickou činnost. Na obec je třeba v případě tohoto projektu hledět jako na podnikatele a jedná se o veřejnou podporu. V tomto případě se uplatní výjimka dle nařízení 1628/2006. Vzhledem k tomu, že obec nespadá pod definici malého a středního podnikatele, má možnost získat na projekt dotaci ve výši max. 40 %.

V době před registrací projektu nesmí být zahájeny práce na projektu zakládajícím veřejnou podporu (tzn., nesmí být zahájeny zejména stavební práce na projektu, nebo nesmí být učiněna závazná objednávka služeb související s realizací projektu).

V některých případech je však možné již předložený (zaregistrovaný) projekt k hodnocení, vyřazený na základě nesplnění formálních náležitostí, kritérií přijatelnosti nebo projekt nedoporučený k financování (tzn. situaci, kdy projekt nedosáhl potřebného množství bodů při bodovém hodnocení), opětovně předložit k hodnocení, přičemž realizace projektu nemusí být do další registrace přerušena (stavební a jiné práce mohou pokračovat, závazná objednávka služeb může být učiněna). Mohou vznikat způsobilé výdaje. Týká se pouze projektů, které v souladu s harmonogramem uvedeným v projektové žádosti prvotně registrovaného projektu, již zahájili realizaci.

Podmínky opětovné registrace projektu jsou řešeny v Metodickém pokynu Úřadu Regionální rady regionu soudržnosti Jihovýchod č. 3/2008 EX, který je k dispozici na http://www.jihovychod.cz/ v záložce „Metodické pokyny".Tento metodický pokyn se týká i projektů, které nezakládají veřejnou podporu.

Jedná se o činnosti vykonávané ve veřejném zájmu. Jsou-li splněny všechny následující podmínky, o veřejnou podporu se nejedná:

• žadatel doložil, že jde o typickou službu, za jejíž zajištění má odpovědnost veřejná správa – veřejná správa prokazatelně rozhodla, že se jedná o službu veřejného zájmu;
• žadatel prokázal, že tuto službu není možné zajistit za tržních podmínek, protože není ekonomicky zisková a zároveň, protože ji nikdo na relevantním trhu nezajišťuje, nelze narušit ani hospodářskou soutěž (musí být splněny obě části bodu b);
• žadatel prokázal, že touto službou, byť teoreticky, nenaruší obchod mezi členskými zeměmi EU – zejména proto, že služba je určena jen pro místní obyvatelstvo a nemá žádný přeshraniční dopad.

1. příjemci je svěřen výkon služeb  ve veřejném zájmu členským státem za těchto podmínek:
2. • službu musí členský stát definovat (obecně závazným předpisem, jiným právním aktem, smlouvou), v pověření musí být vymezena povaha, rozsah a trvání závazku;
   • podnik, jehož průměrný roční obrat nesmí přesáhnout v průběhu dvou fiskálních let částku 100 mil. EUR nebo nemocnice či jiné subjekty.
     
3. vyrovnávací platba:
4. • v nezbytném rozsahu pro plnění závazku (příjmy a přiměřený výnos z vlastního kapitálu nutno odečíst);
   • nesmí být využita na jinou činnost;
   • indikátory, na základě kterých je vypočtena výše platby, jsou určeny předem objektivním a transparentním způsobem;
   • podnik je nutno vybrat procedurou veřejných zakázek nebo na základě analýzy nákladů, kterou by řádně vedený podnik vynaložil na plnění takové služby.

Relevantní trh se vymezuje věcně a prostorově. Věcně relevantní trh zahrnuje veškeré výrobky a/nebo služby považované spotřebiteli z hlediska jejich vlastností, cen a předpokládaného účelu za zaměnitelné.

Vymezené území, na kterém jsou zaměnitelné výrobky a služby za srovnatelných podmínek poptávány a nabízeny, určí odpovědí na následující otázky:

1. Kdo je má cílová skupina? Jde o zákazníky, o které se ucházejí i jiní poskytovatelé služeb?
2. Existuje trh a v něm soutěž pro daný produkt (zboží, služba produkovaná projektem)? Tj. existují jiné podobné subjekty, kterým konkuruji?
3. Mohu svým projektem existenčně ohrozit konkurenci na daném trhu?
4. Jaký vliv má můj projekt na zákazníky z jiných členských zemí? Může dojít k poškození obchodu mezi členskými státy? Působí projekt na trzích otevřených obchodu a hospodářské soutěži?

V případě kladných odpovědí na všechny uvedené otázky a nespadá-li projekt pod výjimku služby v obecném hospodářském zájmu, jedná se o veřejnou podporu, která může být poskytnuta pouze podle podmínek nařízení o regionální investiční podpoře, de minimis či v režimu notifikace schválené Komisí.

Na projekt obsahující jak aktivity zakládající veřejnou podporu, tak aktivity nezakládající, se pohlíží jako na projekt zakládající veřejnou podporu.